गुरुकुल में विज्ञान का प्रयोगिक ज्ञान उपलब्ध कराने के लिए भौतिक तथा रासायनिक विज्ञान की अलग-अलग अत्याधुनिक उपकरणों से युक्त प्रयोगशालाएं विद्यमान हैं। जिनमें प्रयोगों के द्वारा विद्यार्थियों को विज्ञान के सूक्ष्म रहस्यों का प्रत्यक्ष ज्ञान कराया जाता है।